其林贝尔

服务热线:17511683092
17511683092

他们都在找: 96孔微孔板混匀仪QB-8002 旋涡混合器VORTEX-5 多管混匀仪BE-2600
当前位置主页 > 技术支持 >

柑橘黄龙病菌在寄主体内含量动态变化研究

返回列表 来源:未知 发布日期:2019-12-06 09:37【

赣南脐橙是对外贸易中颇具竞争力的农产品, 它具有口感好,营养物质丰富等优点。自2000年 以来,赣南脐橙的种植面积逐渐扩大,其病害问题也 接踵而至,尤为严重的是柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)。HLB 病原菌有三个种,流行最 广 的 是 亚 洲 种(Candidatus liberibacter asisaticus, Las),该病主要通过木虱和苗木调运进行传播。 HLB 的常见症状为黄梢、叶斑驳黄化和红鼻子果, 该病症状很容易与其他柑橘病害混淆,例如柑橘衰 退病染和缺素症。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 试验地点与品种

本研究中柑橘黄龙病监测 点在江西赣州市寻乌县吉谭镇果园,该果园面积约 为6 hm2 ,品种均为脐橙,树龄是10 a左右,果园所处 地貌是为南方常见丘陵地形。当地果农严格施药, 对木虱进行严格防控,调查未发现木虱。

1.1.2 引物与探针

参照 Li 等设计的引物 HLBas/HLBr 和探针 HLBr,以此结合本实验室条件建 立 TaqMan 荧光定量检测体系。此外使用 M13F/ M13R验证含有目的片段载体的阳性克隆。引物和 探针由北京六合华大基因科技有限公司合成,引物 和探针详情。

1.1.3 试剂耗材及仪器

实验中所用试剂包括植物全基因组 DNA 提取试剂盒(Axygen,美国),质粒小 提试剂盒(Axygen,美国),Mpbio Fastprep Lysing A 裂 解 介 质 管(Axygen,美 国 ),DEPC 水(DNase/ RNase-Free/water)(北京索莱宝科技有限公司,中 国),Probe qPCR Mix(宝日医生物技术(北京)有限 公司 ,中国),LB 培养基(Tryptone 15 g,Yeast extract 10 g,NaCl 10 g,pH 7.0),无水乙醇(国药集团 化学试剂有限公司,中国),PBS缓冲液(HyClone,美 国)等。实验所用仪器有普通离心机(Eppendorf,德 国),PCR 仪 和 凝 胶 成 像 分 析 系 统(美 国 ,BIORAD),超低温冰箱 MDF-382E(SANYO,日本)与恒 温冰箱(海尔,青岛),QuantStudio® 6 Flex及核酸蛋 白分析仪(Thermo Fisher Scientific,美国),美国 MPFastPrep-24 5G 研磨机(MP Biomedicals,美国),微 孔板离心机(海门市其林贝尔仪器制造有限公司,中 国)等。

1.2 方法

1.2.1 病害情况调查方法

本实验根据袁亦文等2010年制定的柑橘黄龙病病情分级标准,将果园分 为 5 个病级,其中 1 级:树上有 5~6 梢叶片呈现斑驳 黄化症状;2级:部分侧枝或者主枝出现斑驳黄化症 状,占全树的三分之一以下;3 级:带有斑驳黄化叶 的侧枝或主枝占全树的 1/3~2/3;4 级:带有 HLB 症 状树枝占三分之二以上;5级:全树接近死亡。从1~ 5级区分别选取5株树,共25株树。

1.2.2 植物组织总DNA提取

称取约 100 mg柑橘 叶片中脉,切碎后装入Mpbio Fastprep Lysing A裂解介质管,加入 500 mL PBS 缓冲液,用 MP FastPrep24 5G 研磨机研磨,程序设置:speed 6 m·s -1 ,time 40 s,Quantity 100 mg,cycles 2,pause time 300 s。植物 总 DNA 试 剂 盒 提 取 方 法 参 照 Axygen® 的 Multisource Genomic DNA Miniprep kit 250-prep 说明书, 将提取的DNA放入-20 ℃冰箱保存。

1.2.3 质粒标准品的制备

由北京六合华大科技公 司将HLBas/HLBr扩增片段连接到pUC57-simple载 体上 ,再转化进入大肠杆菌中 ,使用引物 M13F/ M13R进行50 mL体系的PCR验证,验证有条带的阳 性菌液送至华大基因公司进行测序 ,利用 DNAMAN比对验证。取阳性菌液,利用质粒小提试剂盒 提取质粒。

1.2.4 质粒模板拷贝数计算公式

使用核酸蛋白分 析仪测定核酸浓度,将其作为 Las 质粒标准品。将 DNA 的质量浓度转化为模板拷贝数(copy number, CN):CN=(M×N)(/ L×D),M=质量浓度(g · mL- 1 )= DNA(ng · mL- 1 )×10- 6 ,N=阿伏伽德罗常数(6.022× 1023分子/摩尔),L=核酸分子长度(总长度=靶片段+ 载体,单位 kb),D=转换因子(对 dsDNA 为 6.6×105 g·mol-1 ·kb-1 。

2 结果与分析

将 HLBas/HLBr 扩增片段连接到 pUC57-simple 上得到载体pUC57-Las,使用引物M13F/M13R扩增 得到 211 bp特异条带。测序后使用 DNAMAN进行 序 列 比 对 ,与 Las 基 因 组 中 相 应 序 列 相 似 性 为 100%,验证结果正确。标 准 曲 线 y=- 3.369 lg(x)+ 15.738(R2 =0.999, Eff%=98.068)。 y 为 CT 值 ,x 为 DNA 浓 度 ,单 位 ng · mL-1 。将 DNA 浓度转化模板拷贝数,得到公式 Y=−3.369 lg(CN)+44.422(Y 为 CT 值,CN 为模板拷 贝数)。

3 讨 论 

对江西省赣州地区柑橘黄龙病菌在染病 柑橘树体内的流行动态规律进行了监测,发现在 2017 年 8 月到 2018 年 10 月,Las 在树体内的含量会 随着时间变化而波动大体呈现出 2个高峰和 2个低 谷,总体表现为 2017 年 8 月开始 Las 含量先增后降的变化规律。胡浩研究了广西柳州地区染病柑橘 树内 Las含量的动态变化,结果显示在 10 月柑橘黄 龙病菌含量达到最高值,在 3 到 5 月维持在较低水 平。Wang等研究显示Las在染病柑橘树体内变化 规律为在 10月和 12月柑橘黄龙病菌含量达到最高 值,3月和5月维持在较低水平。以上研究均发现在 10月份病树内的 Las含量会达到高峰,5月 Las含量 处于低谷,但本研究中江西柑橘果园内病树的 Las 含量在 6 月也呈现出 1 个高峰。该时段的 Las 含量 较 10 月份的 Las 含量低,但仍是低谷时期 Las 含量 的 10 倍以上。本研究的结果与前人研究结果存在 差异的原因可能是不同果园地理位置气候或者柑橘 自身生长规律的差异导致的。此外本研究果园里的 木虱受到果农严格控制,定期施药,所以木虱对植株 体内 Las 的含量影响较小,与前人的研究结果相互 对比分析,木虱对病树后期 Las 含量的变化影响不大。



 


免责声明:文章仅供学习和交流,如涉及作品版权问题需要我方删除,请联系我们,我们会在第一时间进行处理。